Η οριστική θεραπεία του πρωτοπαθούς υπερπαραθυρεοειδισμού είναι η χειρουργική αφαίρεση του παθολογικού αδένα ή αδένων.
Εφόσον η θέση του παθολογικού παραθυρεοειδούς αδένα έχει εντοπιστεί απεικονιστικά πριν το χειρουργείο, η εκτομή του αδένα μπορεί να γίνει συνήθως μέσω μιας μικρής τομής. Σε περιπτώσεις που ο παθολογικός αδένας δεν απεικονίζεται σε καμία εξέταση προεγχειρητικά ή αν υπάρχει αμφιβολία για τον αριθμό των παθολογικών παραθυρεοειδών, τότε χρειάζεται η λεγόμενη διερεύνηση τραχήλου, η οποία γίνεται μέσω μιας μεγαλύτερης τομής, συνήθως όπως αυτής της θυρεοειδεκτομής.
Τις τελευταίες δεκαετίες προστέθηκε ένα ακόμα πολύτιμο εργαλείο στην επιτυχή χειρουργική θεραπεία του πρωτοπαθούς υπερπαραθυρεοειδισμού, η διεγχειρητική μέτρηση της παραθορμόνης. Με αυτή τη μέθοδο λαμβάνεται αίμα από τον ασθενή για τη μέτρηση παραθορμόνης πριν τη χειρουργική τομή, καθώς και 10 λεπτά μετά την αφαίρεση του παθολογικού αδένα. Η πτώση της τιμής της παραθορμόνης >50% του δεύτερου δείγματος σε σχέση με το πρώτο, επιβεβαιώνει τη θεραπεία του ασθενούς, αλλιώς ο χειρουργός οδηγείται σε περαιτέρω διερεύνηση του τραχήλου.
Η θεραπεία του δευτεροπαθούς υπερπαραθυρεοειδισμού είναι φαρμακευτική κατά βάση, ή η άρση της αιτίας που τον προκαλεί.
Η θεραπεία του τριτοπαθούς υπερπαραθυρεοειδισμού είναι συνήθως ίδια με αυτή του πρωτοπαθούς.